Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r34G3XA52 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms