Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Srp72F8VQC1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms