Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M1F7CXU4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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