Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm28038F7BCN9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm28038F7BCN9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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