Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm28048F7BCN0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm28048F7BCN0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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