Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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