Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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