Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms