Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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