Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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