Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ryr1E9PZQ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms