Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms