Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms