Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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