Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms