Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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