Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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