Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms