Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms