Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NhsB1AV60 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms