Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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