Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV5

Gm13119, Predicted gene 13119, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13119B1ARV5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm13119B1ARV5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm13119B1ARV5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms