Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms