Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms