Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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