Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Samt1A2BED8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Samt1A2BED8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Samt1A2BED8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Samt1A2BED8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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