Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms