Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8nlA2ABX0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms