Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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