Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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