Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms