Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms