Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms