Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phtf1Q9QZ09 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms