Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms