Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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