Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Kcnip3Q9QXT8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Kcnip3Q9QXT8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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