Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim44Q9QXA7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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