Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc2lQ9JME7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc2lQ9JME7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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