Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms