Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CubnQ9JLB4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms