Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hmgn5Q9JL35 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms