Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nectin1Q9JKF6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nectin1Q9JKF6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms