Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gfra4Q9JJT2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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