Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ccl28Q9JIL2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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