Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zcchc17Q9ESX4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms