Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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