Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RhojQ9ER71 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms