Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms