Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riok3Q9DBU3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms